La MAS se fixe pour but de contribuer à la lutte contre la maladie et la promotion de la santé en général, notamment à travers l’appui technique et financier qu’elle apporte aux  structures de mise en œuvre et aux structures de coordination.

Pour atteindre son but, elle se fixe les objectifs ci-après:

• Servir de cadre de concertation entre les associations et réseaux et leurs partenaires;
• Assurer la coordination des activités des associations et réseaux membres ;
• Servir de centre d’information et de documentation sur la maladie et la promotion de la santé, aussi bien pour les acteurs communautaires, les Institutions que la population générale ;
• Faciliter la disponibilité et l’accessibilité des informations scientifiques fiables et actualisées sur le VIH/SIDA ;
• Valoriser l’expertise des associations, des réseaux et  encourager les échanges d’expériences et la complémentarité ;
• Renforcer les capacités d’intervention de ses associations et réseaux membres ;
• Mobiliser des ressources pour les associations et réseaux membres;
• Contribuer à la mise en œuvre de la politique nationales en matière de santé;
• Documenter et vulgariser les meilleures pratiques en matière de lutte contre la maladie
• Soutenir toutes les initiatives de lutte contre  la maladie  au Burkina Faso.